Schon Anderthalb Jahre später, im August 1804, hatte Beethoven seine dritte Sinfonie „Eroika“ (op.55 Es-Dur) uraufgeführt, im Jahr der Kaiserkrönung Napoleons. Er erntete von Publikum und Kritik Ablehnung, denn zu sehr unterschieden sich Länge (fast 1h) und Komplexität des Werkes von seinen vorigen Werken, es wurde als zu grell und bizarr, aber auch als sittenverderbend beschimpft. Beethoven wollte hier jedoch keine Rücksicht auf die Aufnahmefähigkeit des Publikums nehmen, das die Musik als bequemes Konsumgut sah, sondern ein anspruchsvolles Werk schaffen. Er überforderte ohne Rücksicht das Können und den spieltechnischen Standard seiner Musiker.

Der zweite Satz ist ein durch Barocke Mittel sinfonisierter Marsch, eine musikalische Undenkbarkeit damals, während der dritte Satz ein klassisches Scherzo ist, deshalb auch damals den meisten Zuspruch fand.

Das Finale der Eroika ist oft unterschätzt worden, da es weder einen heiteren Schluss wie so oft bei Haydn, noch ein heroisches Ende wie bei Mozarts Jupitersinfonie , sondern nur einen Variationssatz mit einem Thema gibt.