Die in dieser Arbeit durchgeführten Untersuchungen zur Entwicklung eines Temperatursprungexperiments sind Teil eines von der Deutschen Forschungsgemeinschaft geförderten Projekts über laser-induzierte thermische Gewebsefekte. Ziel dieses Projektes ist es, grundlegende Erkenntnisse über laser-induzierte thermische Gewebsefekte bei kurzzeitigem Erhitzen des Gewebes zu erlangen.
Inhaltsverzeichnis
1 Einleitung
2 Theorie
2.1 Wärmeleitung und thermische Relaxationszeit
2.2 Bewegungsgleichung eines Fluids
2.3 Bewegungsgleichung eines fallenden Wassertropfens
2.4 Das Cr,Tm,Ho:YAG Lasersystem
2.5 Lichtverteilung in Tropfen bei Bestrahlung
2.6 Thermische Proteindenaturierung
2.7 Das Modellenzym alkalische Phosphatase
2.8 Nachweis der Proteinaktivität
3 Temperatursprungexperimente mit Kapillaren
3.1 Konzept
3.2 Material und Methoden
3.3 Ergebnisse
3.4 Diskussion
4 Laserinduzierter Temperatursprung in kleinen Wassertropfen
4.1 Konzept
4.2 Vorversuche
4.3 Konstruktion der klimatisierten Fallstrecke
4.4 Test der klimatisierten Fallstrecke
4.5 Diskussion
5 Zusammenfassung und Ausblick
Zielsetzung und Themen
Die Arbeit untersucht experimentelle Verfahren zur Durchführung von Temperatursprungexperimenten in wässrigen Lösungen, um Denaturierungskinetiken von Enzymen in Zeitbereichen von Millisekunden bis Sekunden zu analysieren.
- Entwicklung eines Temperatursprungexperiments mittels turbulenter Rohrströmung in Kapillaren.
- Untersuchung laserinduzierter Temperatursprünge in frei fallenden Wassertropfen.
- Theoretische Modellierung der Wärmeleitung und Strömungsmechanik bei schnellen Temperaturänderungen.
- Etablierung eines Fluoreszenzassays zum Nachweis der Enzymaktivität (alkalische Phosphatase).
- Konstruktion und Validierung einer klimatisierten Fallstrecke zur Vermeidung von Verdunstung.
Auszug aus dem Buch
2.6 Thermische Proteindenaturierung
Proteine sind Makromoleküle, die aus Aminosäuren aufgebaut sind. Ihre räumliche Konformation wird eingeteilt in Primär-, Sekundär-, Tertiär- und Quartärstruktur. Durch die Primärstruktur wird die Sequenz der Aminosäuren beschrieben. Die Sekundärstruktur beschreibt die 3-dimensionale Anordnung benachbarter Aminosäuren aufgrund sterischer Wechselwirkungen. Beispiele der Sekundärstruktur sind die alpha-Helix und die beta-Faltblattstruktur. Die Tertiärstruktur beschreibt die räumliche Anordnung der durch die Sekundärstruktur beschriebenen Untereinheiten. Sie wird durch Wechselwirkungen oder Bindungen weit entfernter Aminosäuren untereinander und Wechselwirkung der Aminosäuren mit den Lösungsmitteln bestimmt. Eine Quartärstruktur der Proteine beschreibt die räumliche Anordnung mehrerer Polypeptidketten untereinander.
Die räumliche Struktur wird durch eine empfindliche Balance von stabilisierenden und destabilisierenden Wechselwirkungen bestimmt. Die für die Funktionalität der Proteine wichtige räumliche Struktur kann daher leicht durch eine Temperaturerhöhung oder Änderung des pH-Wertes zerstört werden. Das Protein geht von seinem nativen Zustand N über in den entfalteten Zustand D. Die Entfaltung ist im Prinzip reversibel, wenn die ursprünglichen Bedingungen wiederhergestellt werden. In erster Näherung kann die Entfaltung beschrieben werden durch einen Ratenprozeß.
Zusammenfassung der Kapitel
1 Einleitung: Beschreibt die medizinischen Hintergründe der Laseranwendung im Gewebe und die Notwendigkeit, Denaturierungskinetiken von Proteinen in schnellen Zeitskalen zu untersuchen.
2 Theorie: Erläutert die physikalischen Grundlagen der Wärmeleitung, der Strömungsmechanik in Kapillaren und der Proteindenaturierung sowie das eingesetzte Lasersystem.
3 Temperatursprungexperimente mit Kapillaren: Analysiert den Aufbau eines Temperatursprungexperiments unter Nutzung turbulenter Rohrströmung in Kapillaren zur schnellen Erwärmung von Lösungen.
4 Laserinduzierter Temperatursprung in kleinen Wassertropfen: Beschreibt die experimentelle Realisierung der Tropfenerwärmung mittels Laserpulsen und die notwendige klimatisierte Fallstrecke.
5 Zusammenfassung und Ausblick: Fasst die Ergebnisse der entwickelten Methoden zusammen und bewertet die Eignung der Aufbauten für zukünftige biochemische Studien.
Schlüsselwörter
Temperatursprung, Proteindenaturierung, Alkalische Phosphatase, Laserinduzierte Erwärmung, Kapillarströmung, Wassertropfen, Thermische Relaxation, Fluoreszenzassay, Strömungsdynamik, Wärmeleitung, Mikrovolumina, Zeitauflösung, DFG-Projekt, Modellenzym.
Häufig gestellte Fragen
Worum geht es in dieser Arbeit grundsätzlich?
Die Diplomarbeit befasst sich mit der Entwicklung und Untersuchung von experimentellen Verfahren zur Durchführung von Temperatursprungexperimenten in wässrigen Enzymlösungen.
Was sind die zentralen Themenfelder der Arbeit?
Die Schwerpunkte liegen auf der Strömungsphysik, der thermischen Analyse von Flüssigkeiten unter Laserbestrahlung sowie biochemischen Messverfahren zum Nachweis der Proteinaktivität.
Welches primäre Ziel verfolgt die Forschungsarbeit?
Das Ziel ist die experimentelle Zugänglichmachung von Denaturierungskinetiken von Proteinen im Zeitbereich von Millisekunden bis Sekunden.
Welche wissenschaftlichen Methoden werden verwendet?
Es kommen sowohl theoretische Modellierungen (z.B. Lösung der Wärmeleitungsgleichung, numerische Simulationen) als auch experimentelle Aufbauten (z.B. Kapillarsysteme, laserinduzierte Tropfenerwärmung, Fluoreszenzspektroskopie) zum Einsatz.
Was wird im Hauptteil der Arbeit behandelt?
Der Hauptteil gliedert sich in die Untersuchung von Kapillar-Experimenten zur schnellen Aufheizung von Flüssigkeiten und die Konstruktion eines Systems zur laserinduzierten Erwärmung kleiner, frei fallender Wassertropfen samt deren klimatisierter Fallstrecke.
Welche Schlüsselwörter charakterisieren die Arbeit?
Zentrale Begriffe sind Temperatursprung, Proteindenaturierung, alkalische Phosphatase, Laseranwendungen in der Biologie und thermische Relaxationszeiten.
Warum wurde die alkalische Phosphatase als Modellenzym gewählt?
Das Enzym dient zur Erprobung der entwickelten experimentellen Aufbauten, da seine Aktivität durch bekannte fluoreszenzoptische Nachweisverfahren zuverlässig und empfindlich messbar ist.
Welche Herausforderungen traten beim Tropfengenerator auf?
Im Betrieb kam es häufig zu Verstopfungen der Kapillare durch Proteinaggregation oder Agglomeration, was die für die Experimente benötigte konstante Tropfenproduktion über einen Zeitraum von fünf Minuten erschwerte.
- Quote paper
- Patrick Wegner (Author), 2000, Untersuchungen zur Charakterisierung schneller Denaturierungskinetiken von Enzymen im Zeitbereich von Millisekunden bis Sekunden, Munich, GRIN Verlag, https://www.grin.com/document/185762
