Leseprobe
Inhaltsverzeichnis
Zusammenfassung
Abkürzungsverzeichnis
1 Einleitung
1.1 Anwendungen von Sequenzanalysen in der Onkologie
1.2 Pyrosequenzierung als etablierte Methode in der Sequenzanalyse
1.3 Im Rahmen dieser Arbeit untersuchte genetische Marker
1.4 Zielsetzungen dieser Arbeit
2 Material
2.1 Verbrauchsmaterialien
2.2 Zelllinien
2.3 Patientenproben
2.4 Primer
2.5 Kitsysteme
2.6 Reagenzien und Lösungen
2.7 Geräte, Software und Datenbanken
3 Methoden
3.1 DNA-Isolierung aus FFPE-Gewebe
3.2 DNA-Konzentrationsbestimmung
3.2.1 NanoDrop 2000 Spectrophotometer
3.2.2 Qubit® 2.0 Fluorimeter
3.3 Polymerase-Kettenreaktion (PCR)
3.4 Quantitative real-timePCR(qPCR)
3.5 Klonierung mittels TOPO®TA Cloning® - Technologie
3.6 Plasmidisolierung
3.7 Pyrosequenzierung
3.8 Polyacrylamid-Gelelektrophorese (PAGE)
4 Ergebnisse
4.1 Verdünnungsanalysen des Gens U2AF1
4.2 Verdünnungsanalysen des Gens MYD88
4.3 Verdünnungsanalysen des Gens Jak2
5 Diskussion
5.1 U2AF1: Analytische Sensitivität von Codon S34 im Vergleich zu Codon Q157
5.2 MYD88: Sensitivität niedriger als bei Codon S34 trotz Auftreten zusätzlicher Peaks
5.3 Jak2: Anwendung einer Zelllinien-Mischungsstudie zur Evaluierung der Sensitivität des Assays
5.4 Ausblick
Danksagung
Literaturverzeichnis
- Arbeit zitieren
- Lena Thöle (Autor:in), 2014, Quantitative Validierung von Pyrosequenzierungs-Assays für die hämatopathologische Diagnostik, München, GRIN Verlag, https://www.grin.com/document/299936
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